Маргарита Агабекова ханымның несие менеджменті, корпоративтік және шағын және орта бизнес маркетингі, басқаруды реттеу және сәйкестендіруді қоса алғанда, әртүрлі қаржы және банк салаларында 25 жылдан астам кәсіби тәжірибесі бар. Ол беделді халықаралық және қазақстандық қаржы институттарында жұмыс істеді. Соңғы онжылдықтарда Агабекова ханым «Демир Қазақстан Банкі» АҚ, «БанкПозитивті Қазақстан» АҚ, «ҚазИнвестБанк» АҚ және «HSBC Банк Қазақстан» АҚ ЕБ сияқты коммерциялық банктерде басшылық қызметтерді атқарған. Агабекова ханым Шет тілдер университетінің лингвистикалық колледжінің лингвистика бакалавры дәрежесін және Алматы қаласындағы «Әділет» жоғары заң мектебінің магистратурасын тәмамдаған. Сонымен қатар, ол банк ісі және қаржы саласында көптеген мамандандырылған курстардан өтіп, бірнеше бағдарламаларды сәтті аяқтап, тиісті сертификаттарға ие болды.